Ο Στυλιανός Τσομπανίδης γεννήθηκε στην Πάτρα. Σπούδασε θεολογία στα Πανεπιστήμια Θεσσαλονίκης (1984-1988) και Χαϊδελβέργης (1990-1995). Το 1996 αναγορεύτηκε διδάκτορας του Τμήματος Θεολογίας του Α.Π.Θ. Είναι καθηγητής του Τμήματος Θεολογίας της Θεολογικής Σχολής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης με αντικείμενο "Οικουμενική Kίνηση: Ιστορία - Θεολογικοί Διάλογοι".