Ο Μιχάλης Βαφόπουλος γεννήθηκε στην Αθήνα το 1972. Είναι παντρεμένος με τη Σοφία Μπανάκη και έχουν ένα γιο. Σπούδασε την Οικονομική Επιστήμη στο Οικονομικό Πανεπιστήμιο Αθηνών και το Πανεπιστήμιο Αιγαίου και την Πληροφορική Επιστήμη στο Ανοικτό Πανεπιστήμιο Πατρών H διδακτορική του διατριβή σχετικά με την οικονομία του Διαδικτύου έγινε δεκτή στο Πανεπιστήμιο Αιγαίου. Είναι υπότροφος του Ιδρύματος Κρατικών Υποτροφιών και του Οικονομικού Πανεπιστημίου Αθηνών. Έχει διδάξει στο Τμήμα Πολιτισμικής Τεχνολογίας και Επικοινωνίας του Πανεπιστημίου Αιγαίου. Από το 2011 διδάσκει στο Εθνικό Μετσόβειο Πολυτεχνείο. Έχει δημοσιεύσει δεκάδες άρθρα σε διεθνή περιοδικά, συνέδρια και επιστημονικά βιβλία. Είναι δημιουργός του "ηλεκτρονικού χώρου εργασίας" και εισήγαγε πρώτος την επιστήμη του Web στο ελληνικό πανεπιστήμιο, "Ο ηλεκτρονικός χώρος εργασίας" αποτελεί ένα ολοκληρωμένο θεωρητικό και πρακτικό πλαίσιο ανάλυσης της επέκτασης του φυσικού χώρου κάθε ανθρώπου με σκοπό την ατομική και την κοινωνική ανάπτυξη. Στα ενδιαφέροντά του περιλαμβάνονται η ανάλυση και οι επιπτώσεις της ψηφιακής οικονομίας, η οικονομετρία, η περιφερειακή ανάπτυξη, η πολιτιστική οικονομία και η φιλοσοφία της επιστήμης και της τεχνολογίας. Το 2009 διετέλεσε πρόεδρος της οργανωτικής επιτροπής του διεθνούς συνεδρίου της επιστήμης του Web.
Δίνει συχνά διαλέξεις στην Ακαδημία Πολιτών, σε σχολεία και Σχολές Γονέων.