Ο Μάνος Ιωαννίδης γεννήθηκε το 1924 στη Μυτιλήνη από γονείς πρόσφυγες που από το 1927 εγκαταστάθηκαν στην Αθήνα. Φοίτησε σε Δημοτικό Σχολείο του Βύρωνα, στο Γυμνάσιο Παγκρατίου και στη Νομική Σχολή της Αθήνα και έγινε τελικά δικηγόρος. Η αντίστασή του κατά του φασισμού και του ναζισμού ξεκίνησε το 1941, από τα μαθητικά του χρόνια στο Παγκράτι, και στη συνέχεια στο Βύρωνα, όπου αναδείχθηκε σε καπετάνιο του λόχου της συνοικίας του ΕΛΑΣ. Για τη δράση του στάλθηκε στη Σχολή Αξιωματικών του Γενικού Αρχηγείου του ΕΛΑΣ και ονομάστηκε ανθυπολοχαγός. Τοποθετήθηκε επιτελής αξιωματικός στο Πρότυπο Τάγμα Καισαριανής και έλαβε μέρος στις συγκρούσεις του Δεκέμβρη 1944. Μετά τη συμφωνία της Βάρκιζας υπέστη τις διώξεις της τότε Δεξιάς, όπως όλοι οι αγωνιστές της Εθνικής Αντίστασης.