Ο Μανώλης Μπαμπούσης είναι εικαστικός καλλιτέχνης, φωτογράφος, αρχιτέκτονας. Η δουλειά του επικεντρώνεται κυρίως στους θεσμούς, στη μνήμη και στο περιβάλλον. Χρησιμοποιεί τα μέσα της φωτογραφίας, σχέδια, κατασκευές, εγκαταστάσεις και κείμενα. Το 2013 παραιτήθηκε από τακτικός καθηγητής της ΑΣΚΤ, όπου δίδασκε, από το 1999, φωτογραφία.
Έχει πραγματοποιήσει πολλές ατομικές εκθέσεις σε μουσεία και χώρους τέχνης, όπως στο Μουσείο Μπενάκη, 2011, Νew Υork Photofestival, 2009, Camec, La Spezia, 2008, Photography House Μπρατισλάβα, 2008, Γενί Τζαμί, Mουσείο Φωτογραφίας, Θεσσαλονίκη, 2007, ΕΜΣΤ, Αθήνα, 2003, και συμμετάσχει σε ομαδικές στην Ελλάδα και στο εξωτερικό, όπως στην Εθνική Πινακοθήκη Μοντέρνας και Σύγχρονης Τέχνης, Ρώμη 2018, Fridericianum Museum, (συλλογή του ΕΜΣΤ), Κάσελ, 2017, Eidos-Ides, Besanon, 2014, κ.ά. Έργα του βρίσκονται σε ιδιωτικές και δημόσιες συλλογές. Έχουν εκδοθεί μονογραφίες του από το ΕΜΣΤ, το Μουσείο Μπενάκη, το Camec, τις εκδόσεις Εξάντας και από τις εκδόσεις Futura.