Η Λένα Ατζινά γεννήθηκε στην Αθήνα. Σπούδασε πολιτικές επιστήμες στο Πανεπιστήμιο Αθηνών και συνέχισε τις μεταπτυχιακές της σπουδές (DEA) στην ιστορία των δυτικών πολιτισμών στο Paris VII. Το 2001 απέκτησε το διδακτορικό της δίπλωμα από το τμήμα Μεθοδολογίας, Ιστορίας και Θεωρίας της Επιστήμης του Πανεπιστημίου Αθηνών και το τμήμα Εφαρμοσμένων Μαθηματικών και Φυσικών Επιστημών του Εθνικού Μετσόβιου Πολυτεχνείου. Δίδαξε το 2001-2002 στο τμήμα Φιλολογίας του Πανεπιστημίου Πατρών.