Η Ελένη Κανακίδου έχει σπουδάσει Παιδαγωγικές Επιστήμες στο Πανεπιστήμιο Θράκης, Κοινωνιολογία στο Πανεπιστήμιο της Ζυρίχης και Διερμηνεία στη Σχολή Διερμηνέων της Ζυρίχης. Έχει πολυετή διδακτική και ερευνητική εμπειρία στα Πανεπιστήμια Αθηνών, Θράκης, Ελεύθερο Πανεπιστήμιο Βερολίνου και La Catolica της Λίμας, Περού. Τα επιστημονικά της ενδιαφέροντα εστιάζονται σε θέματα μειονοτήτων και κοινωνικών μεταβολών, στον διάλογο των πολιτισμών, τον ρατσισμό, τη διαπολιτισμική και την παγκόσμια αναπτυξιακή εκπαίδευση.