Ο Αλέκος Καλαφάτης γεννήθηκε το 1951 στο Αργοστόλι. Πήρε πτυχία μαθηματικών το 1976 από το Πανεπιστήμιο Πατρών. Το 1977 πήρε μεταπτυχιακό δίπλωμα από το Ινστιτούτο Περιφερειακής Ανάπτυξης της Παντείου. Το 1976-77 διετέλεσε πρόεδρος του συλλόγου σπουδαστών Κεφαλονιάς και Ιθάκης "Μαρίνος Αντύπας". Διετέλεσε επίσης δήμαρχος Αργοστολίου τις τετραετίες 1983-86 και 1991-94. Υπήρξε δημοτικός και νομαρχιακός σύμβουλος Αργοστολίου και Κεφαλονιάς αντιστοίχως. Υπηρέτησε ως βουλευτής από το 1996 έως το 2004. Την τετραετία 2000-2004 υπηρέτησε ως υφυπουργός Ανάπτυξης στις κυβερνήσεις Κώστα Σημίτη. Από το 1998 έως το 2000 ήταν εκλεγμένο μέλος της Κοινοβουλευτικής Ομάδας του ΠΑΣΟΚ. Εργάζεται και ζει μονίμως στην Κεφαλονιά.