O Αγαπητός Ξάνθης κατέχει τον μεταδιδακτορικό τίτλο του Πανεπιστημίου Αιγαίου στο Τμήμα Μεσογειακών Σπουδών για την πρότυπη έρευνα με γνωστικό αντικείμενο: "Διεθνείς Σχέσεις - Γεωοικονομία - Αεροφόρος Τουριστική Ανάπτυξη - (Η περίπτωση του Καστελόριζου)". Πτυχιούχος της Αρχιτεκτονικής Σχολής του Istituto Universitario di Architettura di Venezia - Italia. Μεταπτυχιακό δίπλωμα στο πρόγραμμα "Πολιτικές, Οικονομικές και Διεθνείς Σχέσεις στη Μεσόγειο" του Τμήματος Μεσογειακών Σπουδών του Πανεπιστημίου Αιγαίου. Διδάκτορας του Τμήματος Μεσογειακών Σπουδών του Πανεπιστημίου Αιγαίου, με τίτλο εργασίας "Η Ενεργειακή Πορεία της Ελλάδας στη Νέα Διεθνή Σκηνή".